回忆系统是一个重要的玩法机制，玩家可以通过收集回忆碎片解锁剧情和奖励。游戏中的回忆并非单纯的故事片段，而是与角色成长、战力提升紧密关联的核心内容。从游戏设计来看，回忆无法被抹除或重置，它是角色历程的永久记录，玩家只能通过特定活动或任务补充新的回忆内容。
回忆碎片的获取途径多样，包括主线剧情、限时活动、忍者招募等。每种回忆碎片对应不同的角色或事件，例如宇智波鼬的回忆需要通过挑战特定副本获得，而鸣人的回忆则可能隐藏在生存挑战的奖励中。收集完成后，玩家需在奇拉比处提交碎片以解锁后续剧情或奖励，这一过程不可逆，提交后碎片将永久绑定账号。
从战力系统分析，回忆碎片直接影响角色属性加成。例如解锁宇智波斑的回忆可提升全体火属性忍者5%暴击率，而漩涡玖辛奈的回忆则能增强防御类通灵兽效果。这些加成通过神器系统与雕文强化实现，玩家需消耗忍玉和轮回石升级对应雕文，但已激活的回忆属性无法移除或替换。
游戏中的特殊活动如回忆拼图进一步强化了回忆的不可更改性。该玩法要求玩家将碎片按历史事件顺序拼接，错误操作会导致进度重置但不会删除已获得的碎片。部分限定回忆如终结之谷对决仅在周年庆期间开放获取，错过活动将永久缺失相关收集品。
从剧情设定角度，回忆代表着忍者世界的因果逻辑。游戏通过忍者信息卡片等收集品明确表示，所有已发生的剧情事件都会成为后续任务的触发条件。例如只有集齐晓组织成员的回忆，才能开启忍界大战章节。这种设计确保了游戏叙事的连贯性，也从根本上否定了抹除回忆的可能性。
技术层面来看，回忆数据存储在玩家账号的云端服务器中。即便删除本地游戏数据，通过账号恢复功能仍可完整还原所有回忆进度。官方在2024年9月的更新公告中明确表示，回忆系统不存在数据重置接口，这是出于维护游戏平衡和公平性的必要措施。
